پایان نامه > کتابخانه مرکزی دانشگاه صنعتی شاهرود > شیمی > مقطع کارشناسی ارشد > سال 1405
پدیدآورندگان:
احمد حسن سمیر [پدیدآور اصلی]، قدمعلی باقریان دهقی[استاد راهنما]، منصور عرب چم جنگلی[استاد راهنما]
چکیده:
LIM یک نوع پروتئینی است که در تنظیم عملکرد سلولی نقش دارد. پروتئینکینازها، بهویژه کیناز وابسته به LIM (LIMK)، به دلیل نقش مهمی که در تنظیم ساختار اسکلت سلولی، مهاجرت و تهاجم سلولهای سرطانی دارند، از اهداف مورد توجه در طراحی و توسعه داروهای ضدسرطان به شمار میروند. ازاینرو، مشتقات تتراهیدروپیریدین پیرولوپیریمیدین نیز با توجه به ویژگیهای ساختاری و قابلیت ایجاد برهمکنشهای مناسب با جایگاه فعال پروتئین، میتوانند بهعنوان ترکیبات بالقوه برای مهار LIMK مورد توجه قرار گیرند. با این حال، تعیین تجربی ثابت بازدارندگی (Ki) برای تعداد زیادی از ترکیبات، مستلزم صرف زمان و هزینه قابل توجهی است. لذا در این مطالعه از روش رابطه کمی ساختار-فعالیت برای دستیابی به این هدف استفاده شد. به این منظور روش رگرسیون انقباضی SCAD بهعنوان یک روش انتخاب متغیر به کار گرفته شد و توصیفگرهای مؤثر از میان مجموعه اولیه توصیفگرهای مولکولی شناسایی شدند. استفاده از SCAD امکان کاهش تعداد متغیرهای ورودی، کنترل پیچیدگی مدل و دستیابی به یک مدل تنک و قابل تفسیر را فراهم نمود. در ادامه، توصیفگرهای منتخب بهعنوان ورودی شبکه عصبی مصنوعی قرار گرفتند و مدل غیرخطی SCAD–ANN توسعه داده شد. عملکرد مدل با استفاده از مجموعه آزمون خارجی، اعتبارسنجی حذف تکنمونهای (LOO) و شاخصهای آماری مختلف مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که مدل توسعهیافته از توانایی پیشبینی و قابلیت تعمیم مناسبی برخوردار است؛ بهطوریکه مقدار MSE و R² در مجموعه آزمون خارجی بهترتیب برابر با 03/0 و 91/0 به دست آمد و مقدار Q² حاصل از اعتبارسنجی LOO نیز برابر با 78/0 محاسبه شد. همچنین، مقادیر R² و Q² مدل از حدود پذیرفتهشده در مطالعات QSAR، بهترتیب 6/0 و 5/0 ، بالاتر بودند که بیانگر عملکرد مطلوب مدل در پیشبینی فعالیت زیستی است. مدل نهایی با استفاده از تنها 7 توصیفگر، ساختاری تنک و در عین حال دارای قدرت پیشبینی مناسب ایجاد نمود. سپس از مدل QSAR توسعهیافته برای پیشبینی فعالیت ترکیبات پیشنهادی استفاده شد و بهمنظور بررسی بیشتر قابلیت این ترکیبات در برهمکنش با هدف زیستی، مطالعات داکینگ مولکولی انجام گرفت. نتایج داکینگ، برهمکنش مناسب ترکیبات منتخب با جایگاه فعال LIMK را نشان داد و شواهد محاسباتی حاصل از این روش با پیشبینیهای مدل QSAR در راستای شناسایی ترکیبات بالقوه مهارکننده LIMK قرار داشت.
کلید واژه ها (نمایه ها):
#پروتئین کیناز LIM (LIMK) #مشتقات تتراهیدروپیریدین #SCAD #سرطان #مهارکنندههای پروتئین کیناز
محل نگهداری: کتابخانه مرکزی دانشگاه صنعتی شاهرود
یادداشت: حقوق مادی و معنوی متعلق به دانشگاه صنعتی شاهرود می باشد.
تعداد بازدید کننده: