این پژوهشکده با گروه پژوهشی مکانیک سیالات و هیدرولیک محاسباتی، منابع آب و محیط زیست و همچنین سازه های هیدرولیکی فعالیت خود را در دانشگاه صنعتی شاهرود آغاز می کند.
شایان ذکر است برگزاری موفقیت آمیز کنفرانس بین المللی منابع آب با رویکرد منطقه ای در سال 88 نمونه ای از چشم انداز دانشگاه صنعتی شاهرود به مسأله منابع آب و محیط زیست است.